水霉菌广存于世界各地的淡水或半咸水水域及潮湿土壤中，于死亡的有机物上腐生，为一种常在的霉菌，主要有水霉目（Saprolegniales）、霜霉目（peronosporales）及水节霉目（Leptomitales）等，又以水霉菌（Saprolegnia）最为常见，于10~15℃时最适合生长，25℃以上时各中的游孢子（zoospore）繁殖力减弱，较不易感染.
水霉病的发生主要因为紧迫造成的二次性感染，鱼只因拥挤、移动或其他不良环境因素的影响，造成体表组织受伤，水中的水霉病游孢子即伺机附着，于坏死组织上开始发芽形成菌丝，菌丝除寄生于坏死组织外，尚可漫延侵入附近的正常组织，分泌消化酵素分解周围组织，更而贯穿真皮深入肌肉，使皮肤与肌肉坏死崩解。
水霉病
表层的菌丝则向外延伸，形成如棉絮状的覆盖物，并于末端形成孢子囊，放出游孢子到水中，经由水而传播各处
